本系特色學程包含校級及院級學程。
校級學程
數理財務學程(學士班):統計系、金融系、應數系。
電子物理學分學程(學士班):應物所、應數系。
STEAM學分學程(學士班):教育學院、傳播學院、應數系。
院級學程
數理資訊學程(學士班):應數系、資科系。
巨量資料學程(學士班):統計系、資管系、資科系、應數系。
精算統計學程(學士班):風管系、統計系、應數系
教育學程(學士班):師培中心、應數系
金融科技專長學程(學士班):資科系、應數系、資管系、財管系、風管系、金融系、統計系、國貿系、科智所
財務工程碩士學程(碩士班):金融系、統計系、應數系。